造礁石珊瑚165种、礁栖鱼类184种、环境DNA检出海洋生物超2700种、国家一级保护野生动物绿海龟栖息——黄岩岛蓝洞及周边海域的生物多样性数据令人惊叹。生态环境部华南环境科学研究所这份报告，首次系统呈现了黄岩岛蓝洞作为珊瑚礁生态系统关键生境的生态价值。

本次调查在黄岩岛蓝洞及周边海域累计记录造礁石珊瑚14科44属165种。在蓝洞洞内，共记录3科6属造礁石珊瑚，包括滨珊瑚属、鹿角珊瑚属、角孔珊瑚属、盘星珊瑚属、星孔珊瑚属、角蜂巢珊瑚属。上述造礁石珊瑚均为黄岩岛珊瑚礁潟湖区常见珊瑚属物种，均为我国二级保护野生动物。
现场拍摄的图像记录了蓝洞侧壁分布的澄黄滨珊瑚、诺福克角孔珊瑚、圆目星孔珊瑚、五边角蜂巢珊瑚等物种。这些珊瑚在蓝洞侧壁的分布表明，尽管蓝洞内部存在高浊度水体分层现象，但仍具备珊瑚栖息和生长的条件。造礁石珊瑚是珊瑚礁生态系统的基石物种，它们通过构建碳酸钙骨骼形成三维礁体结构，为其他海洋生物提供栖息场所。

本次调查在蓝洞内记录砗磲2属2种，包括番红砗磲与砗蚝。其中，砗蚝是较2024年调查多记录到的砗磲物种，在南海热带珊瑚礁区较为少见。
砗蚝隶属于砗磲科砗蚝属，为我国二级保护野生动物，被列入《世界自然保护联盟濒危物种红色名录》。砗蚝壳形呈菱形，两侧大小相等，外壳曲起成弓状，壳长通常约23厘米，最大个体超过40厘米，壳体厚重可达10公斤。壳面常呈黄白色，具有8至12条粗细不均的放射肋，肋上有小鳞片或棘，通常有放射状的紫红色小斑点。砗蚝外套膜不延伸出壳的边缘之外，这一性状特征与砗磲属存在显著差异。本次调查仅见于蓝洞侧壁浅水区。
番红砗磲个体大小通常不超过20厘米，具有一个大的足丝孔，壳面黄白或略带红色。外套膜绚丽多彩，表面常有各色花纹。本次调查多见于黄岩岛珊瑚礁礁坪、潟湖以及蓝洞浅水区域的侧壁处。砗磲具有造礁护礁功能，对于促进珊瑚礁礁体生长、维护珊瑚礁生态平衡具有重要作用。

本次调查在蓝洞共记录礁栖鱼类16科25属33种。包括丝蝴蝶鱼、绿唇鹦嘴鱼、双斑金翅雀鲷、触须蓑鲉、污色绿鹦嘴鱼、显盘雀鲷、栉齿刺尾鱼、横带唇鱼、条斑副绯鲤、棕吻鹦嘴鱼、多带副绯鲤等。珊瑚礁鱼类除具有重要的经济价值外，对珊瑚礁生态系统中的物质循环、能量流动、生态平衡维持具有重要作用。珊瑚礁蓝洞可为礁栖鱼类提供栖息、觅食和躲避灾害的生境，对维护黄岩岛珊瑚礁生态健康具有积极作用。
本次调查利用环境DNA技术，在蓝洞洞内水体中记录到大型旗舰物种绿海龟活动，同时基于现场调查在蓝洞周边海域记录到绿海龟活动。绿海龟为我国一级保护野生动物，具有抑制礁区竞争性藻类生长、调控食物网结构等核心生态功能，对于维持黄岩岛海域生物多样性与生态平衡具有重要作用。绿海龟在蓝洞周边的出现，揭示了蓝洞与周边珊瑚礁、海草床等自然生态系统之间的连通性。