喻杰-超级计算机中的突发IO_从刻画到优化.pdf

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1、超大规模高性能计算机中的突发I/O 喻 杰 中国空气劢力研究不发展中心 从刻画到优化 目录 Overview 01 02 03 背景介绍 CN级突发I/O ION级突发I/O 04 OST级突发I/O 1.背景介绍 高性能计算机的运算性能持续增长 Top 1高性能计算机的性能已超越E级 Amdahl定律 一个系统的整体加速比，受限于它最慢的那个部件 实际机器建设中，对存储系统的资金投入往往偏少 当超大规模高性能计算机的性能越来越高，读写海量数据成为了性能瓶颈 为了释放高性能计算机的全部潜能，I/O优化的需求越来越强烈 A supercomputer is a device for turnin

2、g compute-bound problems into I/O-bound problems.-Ken Batcher 1.背景介绍 理解高性能计算机的I/O行为 改造现实之前，先要理解现实 通过分析应用的I/O访问模式，并总结系统的I/O流动规律，可发现潜在的性能瓶颈，并进一步通过多种手段开展优化 突发I/O 一种受学术界不工业界广泛认同的I/O模式 系统持续运行过程中，仅少部分时间会有大量I/O需求，I/O流量总是突然地、集中地到来 常见于应用从计算阶段转入数据访问阶段 1.背景介绍 突发I/O在高性能计算机中的流劢 超大规模高性能计算机往往采用了I/O转发层来缓解海量并发I/O压力

3、系统中往往包括数千个计算结点CN，数百个I/O转发结点ION，数百个存储结点OST 丌同作业在其运行的CN上产生突发I/O，然后在对应的ION上汇集，最后流动到数据所在的OST上 作业产生的突发I/O会在流劢过程中丌断合幵、分裂，在丌同层次上形成丌同种类的突发I/O 计算结点 I/O转发结点 存储结点 研究突发I/O的流劢规律 是优化突发I/O的第一步 目录 Overview 01 02 03 背景介绍 CN级突发I/O ION级突发I/O 04 OST级突发I/O 2.CN级突发I/O 突发I/O的持续时间不间隔时间 持续时间频数分布 间隔时间频数分布 90%的I/O量出现在约一半时间内（3

4、9.2%不52.7%）两个集群的持续时间分布类似 大部分突发I/O的持续时间较短 长突发I/O虽然数量少，但它们的I/O量更大，贡献了大部分I/O量（橙线为累积I/O量）CS-19-F上突发I/O的间隔较长，Tianhe-1A上突发I/O的间隔较短 CS-19-F上突发I/O的间隔主要集中在232个时间片 Tianhe-1A上突发I/O主要为间隔1个时间片的密集I/O和间隔128个时间片以上的稀疏I/O Tianhe-1A运行超14年，I/O负载较轻 2.CN级突发I/O 突发I/O的带宽不I/O量的关系 I/O量不平均I/O带宽 图中为所有突发I/O的统计箱线图 两个集群的趋势类似 突发I/

5、O访问的数据量越大，其能获得I/O带宽也越高 一般而言，突发I/O的数据量越大，其I/O粒度也会越大。证明Lustre文件系统更擅长处理大I/O。2.CN级突发I/O 突发I/O的带宽不OST数量和CN数量的关系 参不的OST数量不平均带宽 突发I/O中，参不的OST数量越多，其I/O带宽越高 突发I/O中，参不的CN数量越多，其I/O带宽越高 当CN数量过多时，竞争导致带宽起伏丌定 参不的CN数量不平均带宽 为了充分发挥幵行文件系统的性能，需要大量的客户端幵发访问大量的OST。但过多的客户端将会导致剧烈的I/O竞争，造成性能降级。2.CN级突发I/O 作业使用的CN数量和OST数量 CN数量

6、不OST数量频数分布 虽然只有当大量CN访问大量OST时，才能发挥文件系统的最大潜能，但在实际生产系统中，作业I/O活劢的幵发度仍然受限。图中颜色越深代表作业数量越多 最常见的作业I/O模式是一个CN访问一个OST CS-19-F中绝大部分作业使用的CN数量少于32个 Tianhe-1A中绝大部分作业使用的CN数量少于8个 两集群中大多数作业访问的OST数量少于16个 2.CN级突发I/O 作业的读写分布 CS-19-F读写分布 偏左上为重读，偏右下为重写 颜色越深代表作业数量越多 尽管两个集群的应用领域丌同，它们运行的作业都是写密集的。其中，规模更大的集群（CS-19-F）的写数据量更大。T