2019年科学数据的引用、交互和规范化研究.pdf

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1、科学数据的引用、交互和规范化研究提纲1.现状和背景2.我国总体科学数据引用情况分析3.生物多样性领域案例数据的演化Jeff Tuzik,2015:http:/ 全国科学技术名词:20万+全球ORCID作者库 STKOS:60万+中国分类主题词表:10万+Wikidata:500万+各类领域本体资源服务 文献:文章、图书、学位论文 专利 馆藏(标本/档案/图书/博物馆)科学数据 多媒体 算法、代码 资源订购边界扩展性:各类植物图像库的资源累计超过1000万张(还是不到2万个物种)。系统性:中国总共有3.4万种高等植物,其中有图像的植物物种不到2万种。分析挖掘:计量分析内容内容分析工具软件 数量S

2、PSS327MATLAB1153ArcGIS528mapinfo18arcinfo106开源335excel127mysql59Sql server59Oracle120superMap28Ansys 568Fluent159ERDAS60编程语言 数量python40java367VB484c+462perl44php62javascript37R语言5Scala33Fortran58c#6528万篇中科院中文文章机构国别作者主题词学科年度Bari Manifesto(巴里宣言)改进生物多样性信息学的10个原则1.DMP(Data Management Plan,数据管理计划)2.Data

3、structure(数据结构)3.Metadata(元数据)4.Data quality(数据质量)5.Services(服务)6.Workflows(工作流)7.Provenance(出处)8.Ontologies/vocabularies(本体/术语表)9.Data preservation(数据存储)10.Accessibility(可访问性)Hardisty,A.R.,Michener,W.K.,Agosti,D.et al.(2019).The Bari Manifesto:An interoperability framework for essential biodiversit

4、y variables.Ecological Informatics,49,22-31.https:/doi.org/10.1016/j.ecoinf.2018.11.0032018年2月26-28日在意大利巴里召开GLOBIS-B项目研讨会,重点讨论BRIs(Biodiversity Research Infrastructures,生物多样性研究基础设施)的交互操作。下一步计划:1.Standards bodies(标准体建设)2.BRIs(生物多样性研究基础设施)3.Research communities(研究社区)4.Research and infrastructure funde

5、rs(资助基金)原始数据EBV数据产品相关指标物种2000中国节点The Plant List物种2000全球节点International Plant Names Index(IPNI)植物志动物志名录GBIF,全球最大NSII(国家标本资源共享平台)iDigBio,北美最大标本平台Atlas of Living AustraliaCForBio&SinoBONGlobal Plants on JSTOR科技基础条件平台&科学数据库标本&观测CFH(中国自然标本馆PPBC(中国植物图像库)中国鸟网科学数据库中的生物图像EOL(Encyclopedia of Life)澳大利亚植物图像索引美国

6、农业部植物图像集 Wikispecies,wikipedia图像BHL(生物多样性历史文献图书馆)BHL中国节点eFlora.org在线植物志项目中国植物志在线版中国动物志在线版文献 Barcode of Life Data Systems NCBI 中国西南野生生物种质资源库 中国珍稀濒危植物DNA条形码 中药材DNA条形码鉴定系统DNA序列 澳门生物多样性数据中心 香港农业、渔业和保护部 台湾GBIF节点 四川省自然科技资源共享平台 广西植物资源信息共享平台地方资源资源类型:拼图“3S”数据资源GPS:传感器、无人机、内置定位装置GIS:GIS图层和GIS服务:WMS、TMSRS:近地面遥

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